Kit tách chiết DNA/RNA thực vật cho PCR, qPCR

Kit tách chiết DNA/RNA thực vật là bộ hóa chất dùng cột silica để thu DNA hoặc RNA tinh sạch từ lá, rễ và nấm, sẵn sàng cho PCR, qPCR và giải trình tự. Với mẫu thực vật, kit tốt phải xử lý được vách tế bào cứng, đa đường, polyphenol và RNase nội sinh.

TopPURE® Plant DNA Extraction Kit (HE-009) và TopPURE® Plant RNA Extraction Kit (HE-010) là cặp kit phân phối tại Genobi, tách DNA trong 45 phút cho 6 mẫu và RNA trong 30 phút cho 10 mẫu.

Vì sao tách chiết từ thực vật khó hơn bạn nghĩ?

Nhiều bạn làm lab lần đầu gặp cùng một tình huống: quy trình đúng từng bước, nhưng đo ra DNA nâu xỉn, PCR không lên band, hoặc RNA gel smear. Lỗi thường không nằm ở tay nghề mà ở đặc thù của mẫu thực vật.

• Vách tế bào cellulose dày: khó phá vỡ, nếu nghiền chưa mịn thì hiệu suất thu hồi thấp.
• Đa đường (polysaccharide): dễ đồng kết tủa với nucleic acid, làm dịch chiết nhớt và ức chế enzyme trong PCR.
• Polyphenol và hợp chất thứ cấp: bị oxy hóa thành chất màu nâu, bám vào DNA/RNA và làm giảm độ tinh sạch.
• RNase nội sinh: với RNA, chỉ cần một chút chậm tay là RNA bị cắt nhỏ.

Vì vậy, chọn kit cho thực vật không chỉ là chọn “kit tách chiết” chung chung. Bạn cần bộ đệm ly giải và quy trình tối ưu cho đúng loại mẫu.

Tách DNA hay tách RNA: nên chọn loại nào?

Câu trả lời phụ thuộc vào câu hỏi nghiên cứu của bạn.

Chọn DNA khi bạn cần biết “cây này là gì” hoặc “cây này mang gen gì”: định danh loài, phát hiện GMO, phân tích SNP, xác thực dược liệu, kiểm tra nguồn gốc nguyên liệu thực phẩm.

Chọn RNA khi bạn cần biết “gen nào đang hoạt động”: phân tích biểu hiện gen bằng RT-qPCR, nghiên cứu phản ứng stress hạn, mặn, sâu bệnh, hoặc chuẩn bị mẫu cho giải trình tự.

Nhiều dự án cần cả hai: DNA để xác định kiểu gen, RNA để xem gen biểu hiện thế nào. Khi đó, dùng một cặp kit cùng hệ thống sẽ giúp quy trình đồng nhất, dễ chuẩn hóa và dễ đào tạo nhân sự.

Tiêu chí chọn Kit tách chiết DNA/RNA thực vật

Trước khi đặt hàng, hãy đối chiếu kit với năm tiêu chí sau:

1. Loại mẫu phù hợp: kit phải ghi rõ dùng cho lá, rễ, nấm hay cả mẫu thực phẩm.
2. Độ tinh sạch: tỷ lệ A260/A280 là chỉ số đầu tiên để kiểm tra nhanh.
3. Thời gian và thông lượng: lab chạy nhiều mẫu mỗi ngày cần quy trình gọn.
4. Tính tiện lợi: hóa chất có đủ trọn bộ không, hay phải tự chuẩn bị thêm?
5. Điều kiện bảo quản: kit bảo quản được ở nhiệt độ phòng sẽ tiết kiệm chỗ trong tủ lạnh và giảm rủi ro khi vận chuyển.

TopPURE® Plant DNA Extraction Kit (HE-009)

Đây là kit tách chiết DNA bằng cột silica, dùng cho mô thực vật (lá, rễ), mẫu thực phẩm và mẫu nấm. Hãng sản xuất theo tiêu chuẩn ISO 9001 và ISO 13485.

• Lượng mẫu đầu vào: 30–100 mg
• Thể tích thu DNA: 50 µL
• Thời gian: 45 phút cho 6 mẫu
• Độ tinh sạch: A260/A280 khoảng 1,7–2,2
• Hệ đệm: PSL1, PSL2 và PBB, kết hợp RNase A để loại RNA lẫn trong dịch chiết
• Quy cách: 50 test, hạn dùng 24 tháng
• Bảo quản: 15–35°C, riêng RNase A bảo quản ở −20°C

DNA thu được dùng trực tiếp cho Real-time PCR, giải trình tự, Southern blot và phân tích SNP.

TopPURE® Plant RNA Extraction Kit (HE-010)

Kit này tách RNA từ lá, rễ và nấm, cũng dùng công nghệ cột silica với hệ đệm ly giải tối ưu cho hiệu suất thu hồi và độ tinh sạch cao.

• Lượng mẫu đầu vào: 30–100 mg
• Thể tích thu RNA: 50 µL
• Thời gian: 30 phút cho 10 mẫu
• Độ tinh sạch: A260/A280 ≥ 1,7
• Hệ đệm: PRL, PRB, WB1, WB2, EB
• Quy cách: 50 test, hạn dùng 24 tháng
• Bảo quản: 15–35°C, không cần trữ lạnh

RNA thu được phù hợp cho RT-PCR, Real-time PCR và giải trình tự. Điểm được đánh giá cao là kit đã được cải tiến để bảo quản ở nhiệt độ phòng với hạn dùng dài, giúp lab giảm chi phí và bớt lo về dây chuyền lạnh.

So sánh nhanh HE-009 và HE-010

Tiêu chí	HE-009 (DNA)	HE-010 (RNA)
Mẫu đầu vào	Lá, rễ, thực phẩm, nấm	Lá, rễ, nấm
Lượng mẫu	30–100 mg	30–100 mg
Thời gian	45 phút / 6 mẫu	30 phút / 10 mẫu
Độ tinh sạch (A260/A280)	1,7–2,2	≥ 1,7
Thể tích thu	50 µL	50 µL
Ứng dụng chính	qPCR, giải trình tự, SNP, Southern blot	RT-PCR, qPCR, giải trình tự
Bảo quản	15–35°C (RNase A: −20°C)	15–35°C
Quy cách	50 test	50 test

Năm mẹo giúp tăng chất lượng mẫu ngay từ đầu

1. Nghiền thật mịn: với lá, nên nghiền lạnh (ví dụ trong nitơ lỏng) để phá vách tế bào mà không làm nóng mẫu.
2. Dùng mô non, khỏe: lá non thường ít đa đường và polyphenol hơn mô già.
3. Xử lý mẫu nhanh, bảo quản đúng: mẫu để lâu ở nhiệt độ phòng dễ bị phân hủy, nhất là với RNA.
4. Với RNA, giữ môi trường không RNase: dùng đầu tip có lọc, ống RNase-free, đeo găng và thay găng thường xuyên.
5. Đừng quên thêm ethanol vào dung dịch rửa trước lần dùng đầu tiên, theo hướng dẫn trên nhãn chai. Đây là bước rất dễ bị bỏ sót.

Nếu quy trình RT-qPCR của bạn nhạy với DNA genome lẫn vào RNA, hãy cân nhắc thêm bước xử lý DNase theo đúng quy trình của lab.

Câu hỏi thường gặp

• Tách DNA từ lá cây mất bao lâu?

Với TopPURE® Plant DNA Extraction Kit (HE-009), quy trình mất khoảng 45 phút cho 6 mẫu.

• Cần bao nhiêu mẫu để tách DNA hoặc RNA thực vật?

Cả HE-009 và HE-010 dùng 30–100 mg mô mỗi mẫu.

• Kit tách chiết DNA thực vật có dùng được cho nấm và thực phẩm không?

Có. HE-009 dùng cho mô thực vật, mẫu thực phẩm và mẫu nấm.

• Kit tách RNA thực vật có cần bảo quản lạnh không?

Không. HE-010 bảo quản ở 15–35°C, hạn dùng 24 tháng kể từ ngày sản xuất.

• DNA/RNA thu được dùng cho ứng dụng nào?

DNA từ HE-009 dùng cho Real-time PCR, giải trình tự, Southern blot, SNP. RNA từ HE-010 dùng cho RT-PCR, Real-time PCR và giải trình tự.

• Mỗi hộp kit chạy được bao nhiêu mẫu?

Cả hai kit đều đóng gói 50 test.

Tóm lại: một cặp kit, hai câu hỏi khoa học

Tách chiết tốt là bước quyết định chất lượng của mọi kết quả phía sau. Một mẫu DNA hay RNA sạch giúp PCR lên band rõ, qPCR ổn định và dữ liệu giải trình tự đáng tin cậy. Với thực vật, điều đó càng quan trọng vì mẫu vốn “khó tính”.

Cặp kit TopPURE® giải quyết đúng những điểm hay vướng: quy trình gọn (45 phút cho DNA, 30 phút cho RNA), độ tinh sạch được công bố rõ, hóa chất đi kèm trọn bộ và bảo quản ở nhiệt độ phòng. Sản xuất theo tiêu chuẩn ISO 9001 và ISO 13485, hai kit này phù hợp cho phòng lab nghiên cứu, kiểm nghiệm thực phẩm và cơ sở chọn tạo giống.

Sẵn sàng nâng chất lượng mẫu của bạn? •     TopPURE® Plant DNA Extraction Kit (HE-009): tách DNA từ lá, rễ, thực phẩm, nấm. Quy cách 50 test. •     TopPURE® Plant RNA Extraction Kit (HE-010): tách RNA từ lá, rễ, nấm. Quy cách 50 test. Liên hệ Genobi ngay hôm nay để được tư vấn chọn Kit tách chiết DNA/RNA thực vật, nhận báo giá và hỗ trợ kỹ thuật: genobivn.com